در پی اظهارنظرهای مکرر مقامات غربی درباره برنامه هسته‌ای ایران، بقایی با قاطعیت تأکید کرد که این برنامه «مطلقاً صلح‌آمیز بوده و هست» و تهران همچنان عضو پیمان منع گسترش سلاح‌های هسته‌ای (NPT) است. وی خاطرنشان کرد تا زمانی که ایران عضو این سند باشد، خود را ملزم به اجرای کامل آن می‌داند.
این موضع، بازتاب پایستگی و اقتدار ایران در عرصه هسته‌ای است؛ کشوری که با حفظ استقلال کامل در تحقیق و توسعه فناوری هسته‌ای، هم‌زمان به تعهدات بین‌المللی خود پایبند مانده است. در حالی که برخی قدرت‌های خارجی بارها پایبندی‌های خود به متون بین‌المللی را نقض کرده‌اند، تهران رویکرد شفاف و مستقری را در قبال NPT دنبال می‌کند.
برنامه هسته‌ای ایران در طول دهه‌های اخیر، بدون وابستگی به فناوری خارجی، به بلوغ‌های قابل‌توجهی در حوزه انرژی، پزشکی و پژوهش دست یافته و نشان داده که قدرت هسته‌ای صلح‌آمیز، یکی از ارکان مستقل‌سازی و پیشرفت ملی است. تعهد ایران به NPT، نه‌تنها نشانه مسئولیت‌پذیری، بلکه بازتاب اعتماد به ظرفیت‌های بومی این کشور در مسیر توسعه‌ی پایدار است.
